Q. DreamMaker2を複数使いたい。

A.
方法は二つあります。メニュー画面を必要な数だけ用意します。
このメニュー画面と小説ファイルの双方のCookieIDをそれぞれ任意に書き換えてください。
もっと簡単な方法は、それぞれのメニュー画面と小説ファイルを、それぞれのディレクトリ分だけ作ってその中で管理します。
例 ジャンルAとBがある場合、
http://www.babu.jp/~raika/Dream/a/menu.html
http://www.babu.jp/~raika/Dream/b/menu.html